Σε αντικολλητικό κατσαρολάκι σοτάρετε στο λάδι το κρεμμύδι με την πιπεριά μέχρι να μαλακασώνουν. Προσθέτετε το νταματάκι, αλατοπίπερο και λίγο μοσχοκάρυδο και ανακατεύετε μια δυο φορές. Ρίχνετε ένα φλιτζάνι νερό και αφήνετε τη σάλτσα να σιγοβράσει μέχρι να απορροφηθούν τα υγρά.
Κατεβάζετε τη σάλτσα από τη φωτιά και της ρίχνετε τον τόνο στραγγισμένο απ' τα πολλά λάδια και κομματιασμένο. Ανακατεύετε καλά να πάει παντού.
Βράζετε τα ζυμαρικά σύμφωνα με τις οδηγίες της συσκευασίας τους, τα στραγγίζετε και τα ανακατεύετε με τα ⅔ της σάλτσας. Τα αδειάζετε σε πυρίμαχο οβάλ ή παραλληλόγραμμο σκεύος. Ρίχνετε από πάνω την υπόλοιπη σάλτσα και πασπαλίζετε με τα τυριά και λίγο πιπέρι. Βάζετε για λίγο σε προθερμασμένο φούρνο στους 200°C μέχρι να λιώσει το τυρί.