Καθαρίζετε τα καλαμάρια αφαιρώντας το κόκαλο (μπορείτε να το ζητήσετε και από τον ιχθυοπώλη σας) καιψιλοκόβοντας τα πλοκάμια.
Ανακατεύετε τα ψιλοκομμένα πλοκάμια με τα κρεμμύδια, το κουκουνάρι, τη σταφίδα, το ρύζι, το μαϊντανό, το μισό από το λάδι και ½ κουταλάκι του γλυκού αλάτι. Γεμίζετε τα καλαμάρια με το μείγμα και τα κλείνετε με οδοντογλυφίδα.
Βάζετε τα καλαμαράκια σε ταψάκι.Περιχύνετε τα καλαμάρια με το υπόλοιπο λάδι και αραδιάζετε τις ντομάτες ξεφλουδισμένες και ψιλοκομμένες τριγύρω. Προσθέτετε αλάτι, πιπέρι και μερικούς κόκκους μπαχάρι. Καλύπτετε το ταψάκι με λαδόκολλα.
Ψήνετε στους 170 °C για 1 ώρα περίπου, ελέγχοντας στα μισά αν πρέπει να προσθέσετε λίγο νερό. Ξεσκεπάζετε και συνεχίζετε, αν χρειάζεται, το ψήσιμο για 10’.